Die Erweiterung EX Team Magma vs. Team Aqua ist die vierte Erweiterung des EX-Zyklus und enthält 97 Karten, darunter hauptsächlich Pokémon von Team Magma oder Team Aqua. Zu dieser Erweiterung erschienen auch die Themendecks Team Magma (Cover-Pokémon: Groudon) und Team Aqua (Kyogre).